北京基因組所發(fā)現(xiàn)RNA甲基化調(diào)控基因翻譯機(jī)制
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中國化工儀器網(wǎng) 技術(shù)前沿】中國科學(xué)院北京基因組研究所精準(zhǔn)基因組醫(yī)學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室及遺傳與發(fā)育協(xié)同創(chuàng)新中心楊運(yùn)桂研究組在研究 m6A 甲基化修飾結(jié)合蛋白調(diào)節(jié) mRNA 加工規(guī)律過程中,發(fā)現(xiàn)了讀碼器 YTHDF3 調(diào)控 mRNA 翻譯分子機(jī)制。該研究結(jié)果以 Cytoplasmic m6A reader YTHDF3 promotes mRNA translation 為題于近期在《細(xì)胞研究》(Cell Research)雜志在線發(fā)表。
研究團(tuán)隊(duì)通過串聯(lián)親和沉淀的方法篩選 YTHDF3 和 YTHDF1 的互作蛋白,發(fā)現(xiàn)與其相互作用的主要是核糖體 40S 小亞基蛋白以及 60S 大亞基蛋白。通過 GST pull-down 實(shí)驗(yàn)證明 YTHDF3 與這些核糖體大亞基蛋白和小亞基蛋白存在相互作用。進(jìn)一步的新蛋白合成實(shí)驗(yàn)證明了 YTHDF3 可以促進(jìn) mRNA 的翻譯,因敲低 YTHDF3 引起的翻譯水平的降低只能夠被野生型的 YTHDF3 所回補(bǔ)。結(jié)合轉(zhuǎn)錄組和光交聯(lián) - RNA 測序及生物信息技術(shù),證明 YTHDF3 和 YTHDF1 可以影響各自的 RNA 結(jié)合能力,同時發(fā)現(xiàn) YTHDF3 促進(jìn) YTHDF3 與 YTHDF1 共同結(jié)合的轉(zhuǎn)錄本的翻譯效率,揭示了 YTHDF3 和 YTHDF1 在翻譯過程中的協(xié)同調(diào)控作用。
Cell Research 同期刊發(fā)了芝加哥大學(xué)教授何川的 YTHDF3 調(diào)控 mRNA 翻譯和穩(wěn)定性研究成果。這些研究成果闡明了 m6A 讀碼器 YTHDF3 調(diào)控 mRNA 翻譯的分子機(jī)制,為進(jìn)一步研究 m6A 的生物功能和 RNA 表觀遺傳提供依據(jù),為研究與正常生理(如干細(xì)胞干性維持和分化)或異常病理生命活動(如惡性腫瘤等)關(guān)聯(lián)分子機(jī)理提供新的表觀調(diào)控研究方向。
該項(xiàng)研究得到科技部、國家自然科學(xué)基金和中科院先導(dǎo)等項(xiàng)目的支持。